與此同時，復旦校方也開始了和網絡傳言的博弈。

有不少網友將此事和1994年清華大學學生朱令被投毒案聯系在一起，認為是出于學生間的妒嫉心理。在遭遇鉈中毒后，朱令100%傷殘、全身癱瘓、雙目近乎失明、大腦遲鈍、體重100公斤、基本語言能力喪失。輿論懷疑朱令同宿舍女生蓄意下毒，但至今案件沒有明確的結果。

“多么希望黃洋沒有得到直升復旦博士的機會，機會讓人心如此兇狠。”黃洋的好友在微博上說。“嫉妒說”也成為網絡最早推測出的嫌疑人的作案動機。

復旦大學宣傳部副部長方明當即對此表示否認。他說，受害人黃某與嫌疑人林某并不是同一專業的學生，林某因妒嫉黃某獲得直升博士生機會而起意投毒的說法只是坊間傳言，并非事實。

蜂擁而至的媒體很快也在黃洋同學的口中，否定了“嫉妒說”。黃洋考博過程中成績位于耳鼻喉科第一名，而林森浩研究生專業是醫學影像專業，兩人根本不存在競爭關系。黃洋的父親也告訴記者，黃洋的博士資格是通過考試得來的，不存在侵占他人名額的說法。

在林森浩3月9日的微博上，他提到自己缺席了博士考試。“一度向往，曾糾結，回想起當初找導師的時候信誓旦旦的決心，以及由此跟現導師鬧出的不愉快，正應了兩句話：庸人自擾之，船到橋頭自然直。”很明顯，他和黃洋并不存在博士名額間的競爭。

各地媒體紛紛趕到復旦，也讓學校感到了壓力。在醫學院所在的楓林校區20號宿舍樓下，原本只有宿管阿姨輪班守門，現在多了身穿制服的保安。

事發宿舍是一幢4層高的老式樓房，通道口還貼著“文明衛生樓”的標牌。和兩人熟識的同學，無論如何也想不出兩人間存在矛盾，大家得知此事后第一個反應都是吃驚。“林森浩不可能做出投毒的事，我也不相信林森浩是這樣的人。”有同學說。

隨后，“情殺說”被否認。黃洋的父親說，兒子并沒有女朋友，家人認為，讀書期間找女朋友會影響學習。“仇殺說”也遭遇否定。

在大眾猜疑和否定之時，黃洋在醫院和父母與同學徹底告別。4月16日下午15點29分，復旦大學官方發布了黃洋的死訊。“我們為挽救自己的學生盡了最大的努力。家長失去愛子，學校失去寶貴學生，我們表示沉痛的哀悼！”