第二個階段，以全面兌現奧運環保承諾為標志，以確保奧運期間空氣質量達標為目標。在籌辦和舉辦奧運會過程中，市政府堅決嚴格執行國務院批準的“奧運空氣質量保障措施”，在環境保護部的協調組織下，北京與周邊五個省區市聯防聯控，全社會共同參與，出色地完成了奧運空氣質量保障任務。從1998年到2012年，我市制定實施了十六個階段防治大氣污染措施和年度清潔空氣行動計劃，共200多項具體措施。這些措施的實施，使北京市空氣質量連續14年持續改善，2012年空氣中二氧化硫、二氧化氮和可吸入顆粒物濃度比1998年分別下降了77％、30％和42％。二氧化硫、二氧化氮年均濃度穩定達到國家空氣質量原標準，可吸入顆粒物年均濃度明顯降低。

第三個階段，即現在正在實施的《北京市2013-2017年清潔空氣行動計劃》。確定了指導思想和行動目標，明確了“八大污染減排工程、六大實施保障措施、三大全民參與行動”，“對癥下藥”，將工作重點集中體現在北京市當前的污染物主要來源上，集中在了壓減燃煤、控車減油、治污減排、清潔降塵等四大領域。并就清潔空氣行動計劃進行了細化，發布了《北京市2013-2017年清潔空氣行動計劃重點任務分解》，提出了84項重點任務，明確了工作目標、完成時點、責任主體。通過標本兼治、綜合施策、遠近結合、協調推進，把調整優化結構、強化創新驅動和保護環境生態有機結合起來，政府努力、企業自律、公眾參與，共同完成治理任務，實現目標。